该平台,通过快速高效的单细胞标记、测序和分析,获得单细胞水平的数字化基因表达谱,可对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制大规模单细胞表达图谱。与其他大规模单细胞分选平台相比,通量高、周期快速、成本低、细胞捕获效率高,并且商业化仪器操作简便。但对细胞活性要求较高,大于90%。
原理:
基于10X Genomics平台,利用微流控技术进行单个细胞分选,将带有条形码和引物的凝胶珠和单个细胞包裹在油滴中;在每个油滴内,凝胶珠溶解,细胞裂解释放mRNA,通过逆转录产生用于测序的带条形码的cDNA;液体油层破坏后,cDNA后续进行文库构建,使用Illumina测序平台对文库进行测序检测,即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据,10min内自动完成多至80,000个细胞的捕获,从而实现在单细胞水平进行表达测序的目的。

应用领域:
其有效地解决组织样本无法破解的细胞异质性难题,有助于发现新的细胞类型;并基于大量的单细胞基因表达数据,可进行细胞表达特征聚类、亚群表达特征、标志物筛选等方面的分析,是一种高效的细胞基因表达水平的检测技术,已在发育与生殖、免疫、干细胞分化、肿瘤异质性、神经系统发育以及脑发育等研究领域中有着广泛的应用和研究结果发表。
优势:
与其他高通量捕获平台相比,一次实验可完成多至80,000个细胞的捕获,通量高、周期快速,成本最低、细胞捕获效率高,单个样本细胞捕获率高达65%